SMA (Νωτιαία Μυϊκή Ατροφία), Γονίδιο SMN1
Ορισμός
Είναι νευρομυϊκή νόσος με αυτοσωματική υπολειπόμενη κληρονομικότητα, που εκδηλώνεται με εκφύλιση των κινητικών νευρώνων του νωτιαίου μυελού λόγω απώλειας στο γονίδιο SMN1.
Γιατί εξετάζεται με ανάλυση αριθμού αντιγράφων και όχι με αλληλούχιση:
Τα SMN1 και SMN2 μοιράζονται ταυτότητα νουκλεοτιδίων άνω του 99%, με μόλις 8 νουκλεοτιδικές διαφορές μεταξύ τους. Για τον λόγο αυτό, η τυπική αλληλούχιση DNA δεν μπορεί να διακρίνει αξιόπιστα τα δύο γονίδια. Για τον προσδιορισμό της δόσης του SMN1 απαιτείται στοχευμένη ανάλυση διαγραφής/διπλασιασμού του γονιδίου.
Αυτό εξηγεί γιατί η SMA εξετάζεται ξεχωριστά στο πάνελ φορείας (βλ. όρο Πάνελ Φορέων).
Συχνότητα φορείας (ανά πληθυσμό):
| Πληθυσμός | Συχνότητα |
|---|---|
| Λευκός | 1/45 |
| Ασιατικός | 1/48 |
| Ισπανόφωνος | 1/77 |
| Μαύρος (υποσαχάρια Αφρική) | 1/100 |
Ο ρόλος του αριθμού αντιγράφων SMN2: Το γονίδιο SMN2 παράγει μικρή ποσότητα λειτουργικής πρωτεΐνης και μπορεί να αντισταθμίσει εν μέρει την απώλεια του SMN1. Για τον λόγο αυτό ο αριθμός αντιγράφων SMN2 χρησιμοποιείται για την πρόβλεψη της βαρύτητας της νόσου:
| Αριθμός αντιγράφων SMN2 | Πρόβλεψη |
|---|---|
| 2 αντίγραφα | ~80% πιθανότητα SMA τύπου Ι (πιο βαριά μορφή) |
| 4 ή περισσότερα | ~88% πιθανότητα ηπιότερης πορείας, ικανότητα βάδισης |
Κίνδυνοι και Περιορισμοί
Η ανάλυση αριθμού αντιγράφων δεν μπορεί να εντοπίσει σημειακές μεταλλάξεις εντός του SMN1, σε μικρό ποσοστό φορέων (περίπου 5%) το τεστ μπορεί να βγει αρνητικό (υπολειπόμενος κίνδυνος / residual risk).