SMA (Spinal Musküler Atrofi), SMN1 Geni
Tanım
SMN1 genindeki kayıp nedeniyle omurilikteki motor nöronların bozulmasıyla seyreden, otozomal resesif kalıtılan nöromusküler hastalıktır.
Neden dizileme ile değil, kopya sayısı analiziyle bakılır:
SMN1 ve SMN2 %99'dan fazla nükleotid özdeşliği paylaşır, aralarında yalnızca 8 nükleotid farkı vardır. Bu nedenle standart DNA dizileme, iki geni birbirinden güvenilir biçimde ayırt edemez. SMN1 dozunu belirlemek için gen hedefli delesyon/duplikasyon analizi gerekir.
Bu, taşıyıcılık panelinde SMA'nın neden ayrıca analiz edildiğinin açıklamasıdır (bkz. Taşıyıcılık Paneli terimi).
Taşıyıcılık sıklığı (popülasyona göre):
| Popülasyon | Sıklık |
|---|---|
| Beyaz | 1/45 |
| Asyalı | 1/48 |
| Hispanik | 1/77 |
| Siyah (Sahra altı Afrika) | 1/100 |
SMN2 kopya sayısının rolü: SMN2 geni az miktarda işlevsel protein üretir ve SMN1 kaybını kısmen telafi edebilir. Bu nedenle SMN2 kopya sayısı hastalığın ağırlığını öngörmede kullanılır:
| SMN2 kopya sayısı | Öngörü |
|---|---|
| 2 kopya | ~%80 olasılıkla SMA tip I (en ağır form) |
| 4 veya daha fazla | ~%88 olasılıkla daha hafif seyir, yürüyebilme |
Riskler ve Sınırlamalar
Kopya sayısı analizi, SMN1 içindeki nokta mutasyonlarını saptayamaz, taşıyıcıların küçük bir bölümünde (yaklaşık %5) test negatif çıkabilir (artık risk / residual risk).