OnkoGenetiks® CGP
Определение
Комплексное геномное профилирование (CGP), единый тест на основе NGS, одновременно выявляющий в опухоли замены оснований, инсерции/делеции, изменения числа копий и слияния генов. В примере FoundationOne CDx анализируется 324 гена, а также сообщаются такие биомаркеры, как TMB и MSI.
Метод
Секвенирование нового поколения
Допустимые типы образцов
Солидная опухоль-FFPE, Кровь (ЭДТА)
Описание
Данный тест предлагает комплексное геномное профилирование. В рамках панели секвенируются 500 генных областей, при этом в 46 генных областях выполняется анализ слияний. Анализ MSI в рамках панели выполняется методом секвенирования нового поколения. Результат теста также содержит показатели HRD и TMB. В рамках анализа включены исследования CNV-LOH.
Наследование
Профилирует соматические изменения в опухолевой ткани/крови; поскольку некоторые находки могут иметь germline происхождение, для подтверждения требуется germline тест.