Хромосомный микроматричный анализ (CMA / aCGH)
Определение
Высокоразрешающий тест, выявляющий по всему геному изменения числа копий (CNV), то есть делеции и дупликации, слишком мелкие для обнаружения под микроскопом. Также называется "молекулярным кариотипированием".
Сравнение с кариотипом, данные международного консенсуса (ISCA):
| Микроматричный анализ (CMA) | G-полосный кариотип | |
|---|---|---|
| Диагностическая эффективность | 15–20% | ~3% (кроме синдрома Дауна и распознаваемых синдромов) |
| Сильная сторона | Высокая чувствительность к немикроскопическим (субмикроскопическим) делециям/дупликациям | Видит всю структуру хромосомы |
| Что не видит | Истинно сбалансированные перестройки и низкоуровневый мозаицизм | Мелкие (субмикроскопические) изменения |
Вывод консенсуса:
Имеющиеся данные убедительно поддерживают использование CMA вместо G-полосного кариотипа в качестве теста первой линии цитогенетической диагностики у пациентов с необъяснимой задержкой развития/умственной отсталостью, расстройством аутистического спектра или множественными врожденными аномалиями.
Когда предпочтителен кариотип:
- При подозрении на явный хромосомный синдром (например, синдром Дауна)
- При наличии в семье анамнеза хромосомных перестроек
- При наличии анамнеза повторных выкидышей
Этот последний пункт важен: микроматричный анализ не видит сбалансированные транслокации, однако основной генетической причиной повторных выкидышей является именно носительство сбалансированной транслокации (см. термин Хромосомные изменения). Поэтому при повторных выкидышах назначается кариотип.
Связь с FISH: FISH это таргетный тест, он смотрит на одну заранее определенную область (например, 22q11 синдром Ди Джорджи, 15q11 синдром Прадера-Вилли) и дает быстрый результат. Микроматричный анализ же сканирует весь геном, мишень не требуется. Если клиническое подозрение указывает на конкретный синдром, подходит FISH, если неопределенно, подходит микроматричный анализ.
Риски и ограничения
Сбалансированные перестройки и низкоуровневый мозаицизм, которые не видит CMA, являются относительно редкими причинами аномального фенотипа в этой группе пациентов (<1%), то есть ограничение реально, но на практике оставляет небольшой пробел.
CMA может давать большое число VUS; клиническое значение части изменений числа копий остается неопределенным.