Микросателлитная нестабильность (MSI)
Определение
MSI является показателем ошибок репликации, накапливающихся в микросателлитных участках в результате дисфункции системы репарации ошибочно спаренных нуклеотидов ДНК (MMR) (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2). Высокий уровень MSI (MSI-H) связан с высокой мутационной нагрузкой опухоли и прогнозирует ответ на ингибиторы PD-1, такие как пембролизумаб; MSI-H обнаруживается примерно у 15% колоректальных раков.
Метод
Фрагментный анализ
Принимаемые типы образцов
Свежая опухолевая ткань, FFPE + кровь (ЭДТА)
Описание
Перед анализом генов MMR.
Наследование
Возможны оба варианта, и их различие клинически важно, часть случаев MSI-H (примерно 3% при колоректальном раке) обусловлена наследственными мутациями генов MMR при синдроме Линча, тогда как большинство случаев (примерно 12% при колоректальном раке) связаны со спорадическим/соматическим гиперметилированием промотора MLH1.